Plate-forme RIO

Génomique Structurale de la Levure
CNRS UMR8619
Université Paris Sud - Orsay
IFR 115 Génome
Génopole Evry

Responsables

Herman van Tilbeurgh
Tel : +33 1 69 15 31 55
Herman.Van-Tilbeurgh@ibbmc.u-psud.fr
Sophie Quevillon-Cheruel
Tel : +33 1 69 15 79 68
sophie.cheruel@egm.u-psud.fr

Présentation Générale

Le projet Génomique Structurale de la Levure est installé à l’IBBMC. Le projet pilote initial concernait la détermination expérimentale de la structure de protéines de Levure possédant des repliements inconnus. Au cours de ce projet, nous avons mis en place une plate-forme technologique pour la détermination à haut débit de structure protéiques. Cette plate-forme inclut :

-  le clonage et l’expression de protéines ;
-  la purification et la caractérisation de ces protéines ;
-  leur cristallisation ;
-  la résolution de leur structure tridimensionnelle par diffraction des rayons X ;
-  analyse bioinformatique des séquences protéiques et gestion des données expérimentales.

Afin de raccourcir la durée nécessaire pour l’obtention des structures, nous avons adopté une approche automatique pour beaucoup des étapes dans le processus complexe qui mène du gène à la structure tridimensionnelle. Cet ensemble de technologies et de savoir-faire est aujourd’hui organisé en une plate-forme, ouverte à la communauté scientifique, et qui a acquis le label RIO. Les services suivants sont offerts :

-  Clonage et tests d’expression semi-automatiques dans des hôtes bactériens ;
-  Purification, et si nécessaire reploiement, de protéines sur-exprimées ;
-  Criblage de conditions de cristallisation pour des protéines ou des complexes multi-protéiques purifiés ;
-  Résolution et analyse de la structure tridimensionnelle ;
-  Analyse bioinformatique des séquences protéiques ;
-  Système informatique de gestion et de suivi des données expérimentales.

Services

-  Clonage
-  Tests d’expression
-  Expression en quantité
-  Purification
-  Cristallisation
-  Résolution de la structure tridimensionnelle
-  Services informatiques